中國科學院武漢分院（Wuhan Branch . Chinese Academy of Sciences）籌建于1956年，1970年撤銷，1978年恢復中國科學院武漢分院建制。

中國科學院武漢分院是中國科學院在武漢的派出機構，主要職能是協助院進行所在地區研究所領導班子建設，在授權范圍內代表中國科學院與地方開展合作，為所在地區研究所提供服務，承辦院交辦的有關事務。

據2018年2月研究所官網資料顯示，武漢分院系統包括8個獨立法人單位；有碩士學位授權點25個，博士學位授權點15個，博士后工作流動站6個；共有在職職工1819人，在學研究生1489人，其中博士生756人，碩士生733人 。